Amidaza (AMD)
Encimi:So makromolekularni biološki katalizatorji, večina encimov je beljakovin
amidaza:Katalizira hidrolizo različnih endogenih in tujih alifatskih in aromatskih amidov s prenosom acilne skupine v vodo s proizvodnjo prostih kislin in amoniaka.Hidroksamske kisline in druge organske kisline se pogosto uporabljajo kot zdravila, ker so sestavine rastnih faktorjev, antibiotikov in zaviralcev tumorjev.Amidaze lahko razdelimo na acilaze tipa R in tipa S glede na stereoselektivnost katalizatorja.
Poleg kataliziranja hidrolize amidov lahko amidaza katalizira tudi reakcije prenosa acila v prisotnosti ko-substratov, kot je hidroksilamin.
Amidaze iz različnih virov imajo različno substratno specifičnost, nekatere od njih lahko hidrolizirajo samo aromatske amide, nekatere lahko hidrolizirajo samo alifatske amide, nekatere pa hidrolizirajo α- ali ω-amino amide.Večina aminov ima dobro katalitično aktivnost samo za aciklične ali enostavne aromatske amide, vendar so za kompleksne aromate heterociklični amidi, zlasti amidi z orto substituenti, na splošno nizko aktivni (le nekaj encimov kaže boljše katalitične učinke).
Katalitični mehanizem:
| Encimi | Koda izdelka | Koda izdelka |
| Encim v prahu | ES-AMD-101 ~ ES-AMD-119 | komplet 19 amidaz, 50 mg vsaka 19 kosov * 50 mg / kos, ali druga količina |
| Komplet za presejanje (SynKit) | ES-AMD-1900 | komplet 19 amidaz, 1 mg vsaka 19 kosov * 1 mg / kos |
★ Visoka specifičnost substrata.
★ Močna kiralna selektivnost.
★ Visoka učinkovitost pretvorbe.
★ Manj stranskih proizvodov.
★ Pogoji blage reakcije.
★ Okolju prijazen.
➢ Preverjanje encimov je treba izvesti za posebne substrate zaradi specifičnosti substrata in pridobiti encim, ki katalizira ciljni substrat z najboljšim katalitičnim učinkom.
➢ Nikoli ne pride v stik z ekstremnimi pogoji, kot so: visoka temperatura, visok/nizek pH in organsko topilo z visoko koncentracijo.
➢ Običajno mora reakcijski sistem vključevati substrat, pufersko raztopino (optimalni reakcijski pH encima).Kosubstrati, kot je hidroksilamin, morajo biti prisotni v reakcijskem sistemu za prenos acila.
➢ AMD je treba dodati zadnji v reakcijski sistem z optimalnim pH in temperaturo reakcije.
➢ Vse vrste AMD imajo različne optimalne reakcijske pogoje, zato je treba vsako od njih dodatno preučiti posebej.
Primer 1(1):
Hidrolizna aktivnost na različne amidne substrate
| Substrat | Specifična dejavnost μmol min-1mg-1 | Substrat | Specifična dejavnost μmol min-1mg-1 |
| Acetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| laktamid | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butiramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| izobutiramida | 26.2 | ο-Toluamid | 0,3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | nikotinamid | 1.7 |
| Cikloheksanamid | 19.5 | izonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | pikolinamida | 2.1 |
| metakrilamid | 3.5 | 3-fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1.9 |
| benzamid | 6.8 |
Reakcija je bila izvedena v 50 mM raztopini natrijevega fosfatnega pufra, pH 7,5, pri 70 ℃.
| Amidi | Hidroksilamin | hidrazin |
| Acetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| izobutiramida | 25.0 | 22.7 |
| benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reakcija je bila izvedena v 50 mM raztopini natrijevega fosfatnega pufra, pH 7,5, pri 70 ℃.
Povezana koncentracija reagenta: amidi, 100 mM (benzamid, 10 mM);hidroksilamin in hidrazin, 400 mM;encim 0,9 μM.
Primer 2(2):
Primer 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Ekstremofili, 2001, 5: 183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Procesna biokemija, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Bioorganic Chemistry, 2017, dostopno na spletu 7.
